Spy Kids Carmen en Juni zijn terug om de tweeling Rebecca en Cecil Wilson te helpen om samen met hun gepensioneerde geheim agent stiefmoeder de wereld te redden.
De rollen worden omgedraaid wanneer Carmen en Juni hun geheimagent-ouders moeten redden uit de duivelse klauwen van Alexander Minion.
Carmen en Juni vormen een team met Gary en Gerti Giggles, 2 andere mini geheim agenten, om een slechte wetenschapper een lesje te leren.
Een rebelse prinses wordt onder druk gezet om te trouwen met een schurk van een postsorteerder en vlucht diep het bos in waar ze vriendschap sluit met een groot monster.
Een verwende hond vindt avontuur – en vrienden – op straat wanneer zijn rijke baasje sterft en hij door toedoen van haar hebberige familie op een verkeerde plek belandt.